More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0617 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 442 aa  839    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  52.84 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  52.96 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  53.12 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  53.41 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  47.39 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  50.44 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  47.19 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 430 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  51.42 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  51.9 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  49.66 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  46.24 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  50.71 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  49.02 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  47.26 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  47.26 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  47.26 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  48.37 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  47.41 
 
 		 455 aa  319  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  48.93 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  47.88 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.76 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  33.86 
 
 		 464 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.97 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 434 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  36.15 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.25 
 
 		 441 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 443 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  39 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  32.8 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  32.8 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 420 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  34.59 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.79 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.01 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 432 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.24 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.1 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>