More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8326 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 440 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  56.73 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  55.92 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  53.19 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  55.96 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  51.6 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  51 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  51.24 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  51.16 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  48.4 
 
 		 473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  52.78 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  52.21 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  48.41 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  49.36 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  48.96 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  51.17 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  47.94 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  49.32 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  49.32 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  49.32 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  50.94 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  49.31 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  32.88 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 441 aa  246  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.7 
 
 		 461 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 458 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.63 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.94 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.98 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 		 446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  35.43 
 
 		 432 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  33.18 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.51 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.13 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>