More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 502 aa  971    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  53.42 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  40.41 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  45.07 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  39.73 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  54.12 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  44.36 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  38.91 
 
 		 428 aa  213  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 430 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  32.58 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  24.66 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 473 aa  123  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  31.47 
 
 		 442 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  31.87 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  30.44 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  30.18 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  28.04 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  27.09 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.57 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  27.72 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  27.54 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  25.34 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  27.09 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  25.11 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.05 
 
 		 446 aa  107  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  26.42 
 
 		 443 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  29.12 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  26.11 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  26.94 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 431 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  28.89 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  27.29 
 
 		 419 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  28.72 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  30.43 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  27.49 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  28.7 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  27.58 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  27.58 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  25.55 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  26.72 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  28.62 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  26.23 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  27.6 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  28.08 
 
 		 446 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  25.49 
 
 		 418 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  25.98 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 425 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 424 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 		 343 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  27.29 
 
 		 451 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>