More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1549 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 428 aa  826    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  41.25 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  39.09 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 450 aa  212  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  36.58 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  43.13 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  36.51 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  35.39 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  35.73 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  42.02 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 464 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  30.44 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.21 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  29.98 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  29.57 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.67 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  28.91 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  28.87 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  29.06 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  28.61 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.22 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  28.92 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  28.92 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  27.09 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  28.92 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  29.32 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  28.92 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  27.42 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  28.92 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  27.19 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  28.68 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  29.98 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.17 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>