More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4009 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 441 aa  822    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  45.7 
 
 		 502 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  40.4 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  48.87 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  40.32 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  42.93 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  39.47 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 540 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  34.22 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  32.97 
 
 		 500 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  34.57 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  32.54 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  26.54 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  34.28 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  32.89 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  29.59 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.71 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.69 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  33.13 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.82 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.81 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  27.85 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.36 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.12 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  31.77 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  26.99 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  28.35 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  26.59 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  28.41 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 		 443 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  25.22 
 
 		 450 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  27.74 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  29.07 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  26.11 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  26.11 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  26.92 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  27.92 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  28.76 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.96 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  27.48 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  28.28 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  28.15 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  27.78 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  28.15 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  25.17 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  25.17 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>