More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4110 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.681193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.67 
 
 
260 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.74 
 
 
252 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.65 
 
 
252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.85 
 
 
265 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
239 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
242 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.8 
 
 
271 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
267 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 
239 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 
239 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
233 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
252 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.39 
 
 
252 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
261 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
239 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
248 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
248 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
248 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.84 
 
 
257 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.37 
 
 
261 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
260 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.26 
 
 
261 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
262 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.83 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.84 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
239 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.37 
 
 
251 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.61 
 
 
260 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.37 
 
 
260 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00874231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.51 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.4 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
315 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.89 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.06 
 
 
266 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  36.46 
 
 
847 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.89 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  29.06 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2185  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.55 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.68 
 
 
272 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.08 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
263 aa  95.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
242 aa  95.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.07 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  32.04 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4200  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.38 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0943  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.02 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.04 
 
 
261 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
303 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.95 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
249 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.04 
 
 
261 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  28.39 
 
 
901 aa  94.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
287 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.84 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169206  normal  0.0484523 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.26 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.04 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.64 
 
 
286 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  35.96 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  35.96 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.58 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>