More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3870 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  604  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  66.56 
 
 
324 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  65.79 
 
 
318 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  66.12 
 
 
318 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  58.75 
 
 
313 aa  345  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  65.06 
 
 
313 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.72 
 
 
312 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.92 
 
 
312 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  50.83 
 
 
300 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  53.11 
 
 
312 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  53.51 
 
 
313 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  50.33 
 
 
319 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  48.52 
 
 
317 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  50 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  50.65 
 
 
338 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  41.97 
 
 
334 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.36 
 
 
333 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  44.37 
 
 
327 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.94 
 
 
305 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  39.84 
 
 
298 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  35.93 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35.55 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  34.34 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.94 
 
 
309 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  35.32 
 
 
297 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.05 
 
 
331 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.37 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.16 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.9 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  29.49 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
298 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.59 
 
 
347 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.25 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  31.29 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.39 
 
 
303 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  34.47 
 
 
281 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.07 
 
 
320 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.94 
 
 
317 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  30.69 
 
 
305 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  29.72 
 
 
294 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
325 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  31.34 
 
 
292 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
313 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
339 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  30.41 
 
 
291 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.57 
 
 
311 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.86 
 
 
307 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.21 
 
 
291 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.12 
 
 
299 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.17 
 
 
293 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.55 
 
 
318 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
307 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 
314 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.69 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.21 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  34.34 
 
 
294 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  28.93 
 
 
284 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  28.93 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  34.45 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.61 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.25 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.61 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.61 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  27.65 
 
 
296 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  31.71 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  30.1 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.12 
 
 
292 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  27.55 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.38 
 
 
319 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
322 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.12 
 
 
311 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  27.21 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.33 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  31.07 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  32.11 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.21 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  34.27 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  32.57 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.39 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
289 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  25.86 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  28.67 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
273 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  27.42 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.83 
 
 
269 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.69 
 
 
342 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.71 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 
301 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.72 
 
 
306 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>