More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3819 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  100 
 
 
551 aa  1123    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  64.31 
 
 
538 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  58.74 
 
 
551 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  56.1 
 
 
540 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  55.72 
 
 
540 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  55.35 
 
 
540 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  55.41 
 
 
535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  54.95 
 
 
545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  53.41 
 
 
543 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  53.59 
 
 
543 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  53.96 
 
 
543 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  51.49 
 
 
608 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  54.61 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 
613 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.35 
 
 
613 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 
552 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  48.87 
 
 
613 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  48.13 
 
 
550 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.23 
 
 
553 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  47.69 
 
 
603 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 
614 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
614 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  47.65 
 
 
546 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  51.36 
 
 
531 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  46.93 
 
 
551 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  48.61 
 
 
624 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  46.8 
 
 
557 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  48.42 
 
 
624 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  45.81 
 
 
551 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  46.65 
 
 
553 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  47.86 
 
 
551 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  48.42 
 
 
624 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  46.93 
 
 
665 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  47.5 
 
 
621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  47.5 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.52 
 
 
582 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.57 
 
 
532 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.99 
 
 
593 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  42.37 
 
 
547 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  38.02 
 
 
560 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.01 
 
 
547 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
543 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.28 
 
 
584 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  38.87 
 
 
540 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.63 
 
 
546 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.32 
 
 
564 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  40.42 
 
 
544 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  39.73 
 
 
544 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  37.54 
 
 
611 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  37.37 
 
 
566 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  37.43 
 
 
619 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  36.27 
 
 
611 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  37.99 
 
 
539 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  36.43 
 
 
613 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  37.55 
 
 
543 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.48 
 
 
546 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  38.82 
 
 
543 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  38.82 
 
 
543 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  36.18 
 
 
522 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  38.82 
 
 
543 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  37.12 
 
 
572 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 
546 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  35.91 
 
 
611 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  38.46 
 
 
545 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  38.35 
 
 
538 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
573 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  37.95 
 
 
534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.4 
 
 
578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  35.91 
 
 
570 aa  339  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  37.15 
 
 
565 aa  339  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  32.9 
 
 
627 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  38.72 
 
 
592 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  37.01 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  36.52 
 
 
613 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  35.89 
 
 
640 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  33.81 
 
 
564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  36.64 
 
 
624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  38.53 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.9 
 
 
555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 
535 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
539 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  36.2 
 
 
562 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
609 aa  336  5.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  36.82 
 
 
557 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.87 
 
 
531 aa  336  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  36.69 
 
 
588 aa  336  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
571 aa  335  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  36.11 
 
 
571 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  37.9 
 
 
532 aa  335  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  37.07 
 
 
546 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  36.97 
 
 
573 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  36.48 
 
 
593 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  36.86 
 
 
555 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  37.43 
 
 
606 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  36.65 
 
 
615 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 
629 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  35.83 
 
 
586 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>