More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3748 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3748  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3758  dihydrodipicolinate synthetase  40.21 
 
 
295 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1463  dihydrodipicolinate synthetase  37.89 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6449  dihydrodipicolinate synthetase  35.46 
 
 
300 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8129  dihydrodipicolinate synthetase  36.49 
 
 
306 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6272  dihydrodipicolinate synthetase  35.11 
 
 
301 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0325  dihydrodipicolinate synthetase  38.14 
 
 
310 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6264  dihydrodipicolinate synthetase  35.89 
 
 
306 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5202  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 
300 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.001593  normal  0.0809997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3814  dihydrodipicolinate synthetase  34.46 
 
 
306 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0469  dihydrodipicolinate synthetase  31.96 
 
 
308 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1483  dihydrodipicolinate synthetase  34.47 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7655  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 
307 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2209  dihydrodipicolinate synthetase  29.31 
 
 
311 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3604  dihydrodipicolinate synthetase  37.16 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4291  dihydrodipicolinate synthetase  35.68 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0396513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0359  dihydrodipicolinate synthetase  30.43 
 
 
300 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4114  dihydrodipicolinate synthetase  32.43 
 
 
299 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5196  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 
294 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608528  normal  0.0925463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1818  dihydrodipicolinate synthetase  33.51 
 
 
301 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5466  dihydrodipicolinate synthetase  27.84 
 
 
294 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97097  normal  0.383759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.08 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.42 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
296 aa  89  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  34.1 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 
289 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.02 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.2 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  28.93 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.84 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.78 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  33.51 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  29.44 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  24.9 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1897  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  28.64 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2327  dihydrodipicolinate synthetase  34.6 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11151  predicted protein  32.48 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1836  dihydrodipicolinate synthase  30.84 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  28.45 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  32.57 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2201  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.75 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  32.6 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  24.83 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  29.95 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  33.72 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3407  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  33.14 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6344  dihydrodipicolinate synthase (DHDPS)  30.14 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  0.0384677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  24.71 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.15 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.09 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  26.87 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  26.01 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>