69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0847 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2850  putative ATPase  72.78 
 
 		 511 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.935903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  69.92 
 
 		 566 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3010  AAA ATPase  69.86 
 
 		 563 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  70.12 
 
 		 566 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3625  AAA ATPase  70.75 
 
 		 511 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  69.59 
 
 		 517 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  100 
 
 		 515 aa  1040    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  28.38 
 
 		 376 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  29.71 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  28.73 
 
 		 373 aa  94.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  28.73 
 
 		 373 aa  94.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.73 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  29.5 
 
 		 375 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  27.93 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  28.44 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  27.99 
 
 		 375 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  26.4 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  26.16 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  28.15 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  27.82 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  26.65 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  26.56 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  26.62 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  25.28 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  27.69 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.8 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  27.8 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  25.56 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.44 
 
 		 363 aa  80.1  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  28.25 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  31.12 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  27.6 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.13 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  30.53 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  27.06 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  24.36 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  21.81 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  27.88 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.06 
 
 		 825 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  27.5 
 
 		 486 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  20.5 
 
 		 754 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15131  exodeoxyribonuclease V  28.16 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  26.88 
 
 		 491 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  25.63 
 
 		 792 aa  53.5  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  28.48 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  26.4 
 
 		 747 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  28.62 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  27.92 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  25.65 
 
 		 653 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  36.15 
 
 		 719 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1191  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  25.99 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  23.52 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  46.67 
 
 		 816 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  26.03 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.67 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  37.36 
 
 		 743 aa  47.4  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  26.61 
 
 		 776 aa  47  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.21 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  24.91 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  26.75 
 
 		 924 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  26.75 
 
 		 924 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.04 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  23.83 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.43 
 
 		 530 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  26.67 
 
 		 976 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  26.67 
 
 		 976 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>