106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0238 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  62.2 
 
 
217 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  61.24 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  60.29 
 
 
215 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  56.68 
 
 
226 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  56.46 
 
 
222 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  51.52 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  50.65 
 
 
241 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  48.05 
 
 
241 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  50.21 
 
 
244 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  49.79 
 
 
244 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  52.53 
 
 
229 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  52.78 
 
 
222 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  48.67 
 
 
230 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  50.93 
 
 
219 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  50.47 
 
 
215 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  47.52 
 
 
256 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  49.53 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  195  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  49.53 
 
 
214 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  46.01 
 
 
220 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  42.57 
 
 
257 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  47.27 
 
 
208 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  49.3 
 
 
232 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  39.91 
 
 
208 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  39.47 
 
 
219 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  34.1 
 
 
223 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  45.83 
 
 
151 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.58 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.72 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.83 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  50.88 
 
 
74 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.6 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  28.7 
 
 
226 aa  61.6  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  26.76 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.97 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.42 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  45.33 
 
 
177 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  26.29 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.48 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  29.79 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.57 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  26.29 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  28.24 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  24.77 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  24.77 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  25.98 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  31.48 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  27.91 
 
 
243 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  27.1 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  24.41 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.18 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.06 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  27.09 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.37 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  29.09 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.84 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  26.44 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  25.45 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  26.07 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  56.82 
 
 
77 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  22.12 
 
 
206 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  26.78 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  27.44 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  26.01 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.81 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  26.24 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  25.73 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25.81 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.22 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  26.18 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  25.71 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  25.98 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  26.94 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.59 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  26.58 
 
 
261 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  28.25 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30.16 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  22.83 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  22.27 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  24.06 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  23.98 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  29.8 
 
 
253 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  32 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 
320 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  22.56 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.34 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  27.39 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  29.05 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>