21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4901 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 320 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  53.12 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  52.81 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  51.4 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  51.88 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  50.31 
 
 		 315 aa  338  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  53.58 
 
 		 312 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  49.38 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  50.62 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  44.69 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  42.9 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  44.59 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  45 
 
 		 263 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  44.29 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  45.36 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  55.91 
 
 		 130 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  55.91 
 
 		 130 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  57.81 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.94 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>