21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6744 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  90.87 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  89.35 
 
 		 303 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  85.55 
 
 		 263 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  83.33 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  51.61 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  49.1 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  50.56 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  50.36 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  50.18 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  52.06 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  49.45 
 
 		 315 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  48.13 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  49.63 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  45 
 
 		 320 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  43.73 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  65.33 
 
 		 130 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  65.33 
 
 		 130 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  29.13 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.83 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>