38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4589 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  80.15 
 
 		 312 aa  223  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  71.54 
 
 		 309 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  61.54 
 
 		 306 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  61.74 
 
 		 310 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  59.06 
 
 		 319 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  55.91 
 
 		 320 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  57.72 
 
 		 315 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  56.1 
 
 		 315 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  55.91 
 
 		 320 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  60 
 
 		 303 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  59.13 
 
 		 303 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  48.03 
 
 		 317 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  45.65 
 
 		 318 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  65.33 
 
 		 263 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  65.33 
 
 		 263 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  61.33 
 
 		 264 aa  95.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  33.01 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  32.97 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  34 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.63 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.73 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  34.41 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  31.96 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  40.32 
 
 		 285 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.36 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.93 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  35.44 
 
 		 231 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.07 
 
 		 240 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  38.71 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  38.71 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  34.95 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  34.07 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>