61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2828 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 309 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  83.23 
 
 		 312 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  58.58 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  52.22 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  57.28 
 
 		 306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  51.9 
 
 		 315 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  53.27 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  53.12 
 
 		 319 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  51.88 
 
 		 320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  49.68 
 
 		 318 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  48.22 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  46.34 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  47.74 
 
 		 303 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  48.13 
 
 		 263 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  47.01 
 
 		 263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  48.13 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  71.54 
 
 		 130 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  71.54 
 
 		 130 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  48.44 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  24.72 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  32.37 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.94 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  29.3 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  26.56 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.88 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.46 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  28.17 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  32.82 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  26.83 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.61 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  29.66 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  27.16 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  32.08 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.3 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  25.93 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.68 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.25 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  31.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  30.43 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  23.66 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  33.72 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  31.15 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  25.53 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  25.73 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  24.85 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  24.85 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  34.65 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.3 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  24.11 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.1 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  28.23 
 
 		 224 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.09 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  27.19 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.48 
 
 		 217 aa  42.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  31.16 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>