28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4539 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 310 aa  634    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  61.27 
 
 		 315 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  62.54 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  61.88 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  63.19 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  57.5 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  58.58 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  58.71 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  52.81 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  52.1 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  51.79 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  50.16 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  49.07 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  50.56 
 
 		 263 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  50.56 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  52.43 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  61.74 
 
 		 130 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  61.74 
 
 		 130 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  49.23 
 
 		 151 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.36 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.39 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  27.45 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  28.45 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  31.3 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  28.1 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  26.8 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  27.34 
 
 		 207 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>