38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7577 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  67.19 
 
 
319 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  60.31 
 
 
315 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  58.75 
 
 
315 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  61.88 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  60 
 
 
306 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  53.27 
 
 
309 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  51.4 
 
 
320 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  52.5 
 
 
303 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  51.55 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  51.56 
 
 
303 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  50.65 
 
 
318 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  48.91 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  50.36 
 
 
263 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  52.5 
 
 
264 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  50.36 
 
 
263 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  55.91 
 
 
130 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  55.91 
 
 
130 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  64.06 
 
 
151 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  30.86 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  30.89 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  25.61 
 
 
222 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  26.79 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  27.51 
 
 
241 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.58 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  26.19 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  26.22 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.05 
 
 
227 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.08 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.44 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  28.98 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  29.79 
 
 
248 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.66 
 
 
252 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.71 
 
 
239 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  32.38 
 
 
196 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>