42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1230 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 312 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  83.23 
 
 		 309 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  58.71 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  53.58 
 
 		 320 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  57.1 
 
 		 306 aa  348  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  53.89 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  53.31 
 
 		 315 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  53.31 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  51.55 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  48.39 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  48.55 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  48.23 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  46.15 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  49.63 
 
 		 263 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  50.74 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  80.15 
 
 		 130 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  80.15 
 
 		 130 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  43.94 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.46 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.26 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.21 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  27.71 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.14 
 
 		 224 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.17 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  24.31 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.25 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  25.32 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  23.93 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  30.4 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.07 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  37.68 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  30.58 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  28.87 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  29.29 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  24.32 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>