28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2401 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  100 
 
 		 318 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  52.1 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  50.65 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  49.68 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  48.22 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  48.54 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  47.44 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  49.53 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  48.55 
 
 		 312 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  48.38 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  44.59 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  44.2 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  43.26 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  43.73 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  45.52 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  45.65 
 
 		 130 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  45.65 
 
 		 130 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  43.1 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  32.19 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  32.52 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.74 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  25.97 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  26.37 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.77 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.07 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>