21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0216 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  100 
 
 
319 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  67.19 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  56.43 
 
 
315 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  57.5 
 
 
310 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  56.11 
 
 
315 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  59.38 
 
 
306 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  53.12 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  53.12 
 
 
309 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  53.89 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  51.1 
 
 
303 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  50.16 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  48.22 
 
 
318 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  47.06 
 
 
317 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  52.33 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  51.61 
 
 
263 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  53.76 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  59.06 
 
 
130 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  59.06 
 
 
130 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  64.06 
 
 
151 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  26.43 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  38.81 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>