25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6868 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  95.05 
 
 
303 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  90.87 
 
 
263 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  86.31 
 
 
263 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  82.2 
 
 
264 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  52.5 
 
 
320 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  51.1 
 
 
319 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  51.79 
 
 
310 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  51.75 
 
 
315 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  51.43 
 
 
315 aa  315  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  48.9 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  53.09 
 
 
306 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  48.22 
 
 
309 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  45.31 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  48.39 
 
 
312 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  44.2 
 
 
318 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  60 
 
 
130 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  60 
 
 
130 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  27.43 
 
 
207 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  24.75 
 
 
210 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.01 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.03 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.49 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.57 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>