31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3054 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  94.6 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  62.54 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  60.31 
 
 		 320 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  56.43 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  59.68 
 
 		 306 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  52.22 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  53.31 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  49.38 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  51.09 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  51.43 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  50.48 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  48.54 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  49.45 
 
 		 263 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  49.45 
 
 		 263 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  48 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  57.72 
 
 		 130 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  57.72 
 
 		 130 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  29.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.99 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  26.81 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  27.56 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  25.15 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  28.32 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  26.58 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  23.68 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  28.66 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  25.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  36.62 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>