More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2954 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  66.08 
 
 		 458 aa  641    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 457 aa  932    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  58.26 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  56.29 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  55.46 
 
 		 456 aa  488  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  57.3 
 
 		 455 aa  474  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  55.14 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  43.4 
 
 		 495 aa  346  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  30.66 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 453 aa  150  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.51 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 459 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 395 aa  113  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.89 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  31.67 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 376 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.98 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.74 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.13 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  31.85 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.73 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.46 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.2 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.88 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.36 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 348 aa  73.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.05 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  30.56 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  21.58 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.75 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.92 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.5 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.22 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  32.59 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.37 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.84 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  21.78 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>