More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06120 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_06120  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 365 aa  732    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.12 
 
 		 388 aa  309  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.27 
 
 		 364 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  46.81 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  42.78 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  44.68 
 
 		 362 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  44.03 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 376 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.25 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.25 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.24 
 
 		 362 aa  289  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  45.07 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  45.87 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  45.09 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 361 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.78 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  41.06 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  44.55 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  45.01 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 365 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  40.5 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  43.43 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  41.85 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  40.77 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  41.97 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 366 aa  275  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  45.53 
 
 		 579 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  43.57 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>