More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3401 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 463 aa  928    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  53.14 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  59.1 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  59.23 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  59.1 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.7 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  55.04 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  58.65 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.97 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.67 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.83 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.77 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.15 
 
 		 450 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.2 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.32 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.84 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  49.44 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.43 
 
 		 726 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  47.36 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  46.42 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.61 
 
 		 734 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.13 
 
 		 734 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.69 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.29 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.27 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.09 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.15 
 
 		 735 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.63 
 
 		 721 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.83 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.48 
 
 		 733 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  48.76 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  48.95 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  45.43 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  44.76 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  48.95 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  45.79 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  46.36 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  46.19 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  42.73 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  46.64 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.99 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  46.36 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  48.41 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  45.15 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  43.69 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.65 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  42.33 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  45.1 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  45.71 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  45.94 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  42.25 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  45.9 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  45.22 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  45.76 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  46.47 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  48.15 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  45.1 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  44.65 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  45.91 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>