46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2552 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  68.41 
 
 		 500 aa  635    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  100 
 
 		 473 aa  931    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  67.76 
 
 		 492 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  67.88 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  65.43 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.38 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  48.61 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  52 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  40.5 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  40.96 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  38 
 
 		 468 aa  273  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  38.84 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  38.68 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  37.63 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  34.51 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  33.63 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  33.26 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  33.04 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  34.35 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  33.94 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  31.65 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  32.41 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  29.85 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.84 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  29.69 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  29.24 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  30.42 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  29.56 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.57 
 
 		 459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  29.59 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.67 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  29.26 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  24.45 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  34.36 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.96 
 
 		 566 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.94 
 
 		 566 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.87 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.5 
 
 		 788 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.25 
 
 		 610 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.32 
 
 		 989 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2719  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.42 
 
 		 767 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.69 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.56 
 
 		 574 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0016  hypothetical protein  36.92 
 
 		 325 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054001  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.79 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0436737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>