249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2507 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 449 aa  910    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  52.31 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  51.04 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  53.12 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  53.4 
 
 		 414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.74 
 
 		 292 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.97 
 
 		 296 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.72 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.6 
 
 		 299 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  33.05 
 
 		 299 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.42 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.77 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.52 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.14 
 
 		 272 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.07 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.77 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  35.85 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.82 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.9 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  31.31 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.38 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  29.61 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  31.61 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.78 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.34 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.08 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.88 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.57 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  28.44 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.96 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  32.64 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.09 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.62 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  23.93 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.5 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.19 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.82 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.5 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.84 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  41.07 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.91 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.35 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.51 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  44.44 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  37.72 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.84 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.59 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  37.37 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  31.73 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  31.43 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  30.84 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  38.46 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  38.46 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.46 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  38.46 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.13 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.32 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  34.92 
 
 		 301 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.02 
 
 		 344 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.46 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.98 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  33.82 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  44.44 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 328 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.81 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  23.28 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.32 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  38.89 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  23.71 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  39.78 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  37.84 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  37.84 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.99 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.06 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  39.78 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.29 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.06 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  38.1 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.98 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  34.43 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  34.43 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.23 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.34 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.18 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.77 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  24.48 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  35.58 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.58 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.26 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>