157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1664 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  100 
 
 
479 aa  941    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  56.77 
 
 
459 aa  481  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  55.36 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  41.33 
 
 
440 aa  329  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  44.49 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  39.47 
 
 
456 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  41.63 
 
 
438 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  41.78 
 
 
447 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  41.27 
 
 
436 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  39.35 
 
 
454 aa  286  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.51 
 
 
497 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.78 
 
 
487 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  28.37 
 
 
525 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.24 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  25.41 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  27.14 
 
 
471 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  25.72 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  23.83 
 
 
598 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  24.73 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  25.11 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.81 
 
 
539 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.56 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.84 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.67 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.7 
 
 
545 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.81 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  27.21 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  25.8 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.02 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  29.07 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.64 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  27.36 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.26 
 
 
571 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  25.45 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.32 
 
 
603 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  26.29 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.72 
 
 
775 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.84 
 
 
944 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  32.99 
 
 
513 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  24.34 
 
 
571 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.45 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.69 
 
 
1103 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.9 
 
 
481 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  31.03 
 
 
563 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25.11 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  26.06 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  30.47 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  23.2 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.08 
 
 
506 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.29 
 
 
469 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.99 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  22.04 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.99 
 
 
465 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  21.88 
 
 
698 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.28 
 
 
548 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  25.58 
 
 
468 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  31.82 
 
 
567 aa  57.4  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  24.94 
 
 
468 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  26.09 
 
 
473 aa  57  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.41 
 
 
547 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.27 
 
 
574 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  25.54 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.4 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  25.54 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  24.89 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.61 
 
 
338 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  26.57 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  25.54 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  25.27 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  26.35 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.13 
 
 
466 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.13 
 
 
466 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  26.27 
 
 
468 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  26.14 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  23.11 
 
 
1247 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.12 
 
 
463 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  33.65 
 
 
453 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  23.59 
 
 
466 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  27.6 
 
 
510 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.61 
 
 
549 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  23.32 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  27.36 
 
 
535 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  23.67 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  30.06 
 
 
550 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.38 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.95 
 
 
549 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  26.91 
 
 
536 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  27.73 
 
 
625 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.58 
 
 
416 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  24.08 
 
 
557 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.87 
 
 
471 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  21.79 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.04 
 
 
529 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  26.87 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.84 
 
 
537 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  22.11 
 
 
539 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  26.32 
 
 
540 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  24.55 
 
 
525 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  25.85 
 
 
315 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.41 
 
 
550 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>