225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0903 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0903  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  100 
 
 
316 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301766  normal  0.251972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  62.81 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2782  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  61.61 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.99 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.07 
 
 
364 aa  215  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.36 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.33 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.92 
 
 
307 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.67 
 
 
369 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.82 
 
 
314 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.16 
 
 
314 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.82 
 
 
314 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.82 
 
 
314 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.4 
 
 
310 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.87 
 
 
357 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.34 
 
 
310 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  39 
 
 
316 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.5 
 
 
310 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  37.46 
 
 
332 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.38 
 
 
367 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.31 
 
 
357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  39.59 
 
 
309 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.64 
 
 
357 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  38.1 
 
 
322 aa  195  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.19 
 
 
358 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  37.58 
 
 
321 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  37.92 
 
 
321 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.66 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.58 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.33 
 
 
358 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.78 
 
 
343 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.88 
 
 
368 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.76 
 
 
322 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  38.62 
 
 
353 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.15 
 
 
314 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  35.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.21 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0905  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.81 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  34.67 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  35.33 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.78 
 
 
314 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.68 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  35.71 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  33.02 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  35.13 
 
 
319 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  39.94 
 
 
361 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  35.06 
 
 
326 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.18 
 
 
343 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.57 
 
 
369 aa  168  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  37.63 
 
 
316 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  32.06 
 
 
359 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.54 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.44 
 
 
350 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.44 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  35.02 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.21 
 
 
328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  35.57 
 
 
323 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  36.25 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  32.72 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.33 
 
 
334 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  33.88 
 
 
318 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.39 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4168  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.59 
 
 
343 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.48 
 
 
322 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.6 
 
 
321 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.29 
 
 
309 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.29 
 
 
309 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.09 
 
 
319 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  37.94 
 
 
312 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  33.66 
 
 
324 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  35.46 
 
 
320 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  33.66 
 
 
324 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  33.66 
 
 
324 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  32.27 
 
 
319 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.7 
 
 
325 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37 
 
 
305 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.7 
 
 
326 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  34.11 
 
 
320 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0608  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.93 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.72 
 
 
304 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.54 
 
 
320 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.44 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.63 
 
 
365 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  37.33 
 
 
305 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.93 
 
 
324 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  32.33 
 
 
320 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.42 
 
 
324 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.95 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.3 
 
 
361 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4048  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.84 
 
 
316 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.242583  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0928  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.5 
 
 
347 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.98 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  31.49 
 
 
319 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.27 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  33.23 
 
 
320 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  34.28 
 
 
364 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0128  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.5 
 
 
330 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.79 
 
 
321 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>