241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0833 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  100 
 
 
353 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  69.97 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0928  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  71.14 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0968  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  70.85 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.798844  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0935  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  71.55 
 
 
341 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  64.24 
 
 
343 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4168  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  62.61 
 
 
343 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  50.84 
 
 
364 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  51.4 
 
 
368 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.88 
 
 
367 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.6 
 
 
367 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.03 
 
 
358 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  46.96 
 
 
357 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.02 
 
 
367 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.8 
 
 
369 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.33 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.18 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.75 
 
 
357 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.87 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.69 
 
 
314 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.78 
 
 
316 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.69 
 
 
314 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.69 
 
 
314 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.15 
 
 
358 aa  235  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.69 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.53 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  47.97 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.98 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.78 
 
 
316 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.78 
 
 
316 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  47.51 
 
 
361 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.52 
 
 
324 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  45.6 
 
 
309 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.36 
 
 
316 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  45.19 
 
 
316 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  38.46 
 
 
360 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.36 
 
 
310 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.73 
 
 
361 aa  225  8e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.84 
 
 
314 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0905  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.03 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.67 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  38.51 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  37.05 
 
 
364 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  41.48 
 
 
332 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.23 
 
 
435 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  38.66 
 
 
369 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  41.42 
 
 
364 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  37.61 
 
 
359 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  37.13 
 
 
359 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.29 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  37.5 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  46.23 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.57 
 
 
310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.59 
 
 
314 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.57 
 
 
305 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  39.33 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.58 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  42.57 
 
 
305 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  40.72 
 
 
320 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.04 
 
 
365 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.75 
 
 
325 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  39.33 
 
 
312 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  39.27 
 
 
321 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.95 
 
 
334 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  35.58 
 
 
331 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  38.78 
 
 
326 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  39.73 
 
 
322 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4048  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.16 
 
 
316 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.242583  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.02 
 
 
325 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.83 
 
 
314 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.26 
 
 
324 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  41.61 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.06 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3171  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.67 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.71951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0608  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  48.55 
 
 
314 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  38.01 
 
 
315 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.64 
 
 
350 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.74 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.95 
 
 
317 aa  180  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.1 
 
 
320 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.81 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.83 
 
 
320 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.79 
 
 
304 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.02 
 
 
316 aa  179  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.43 
 
 
322 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  36.73 
 
 
316 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  35.83 
 
 
323 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0903  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.37 
 
 
316 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301766  normal  0.251972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.5 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.07 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.76 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  38.82 
 
 
318 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.45 
 
 
323 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.99 
 
 
325 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.4 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.4 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.4 
 
 
324 aa  169  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.16 
 
 
322 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0984  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.65 
 
 
361 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.233061  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.6 
 
 
324 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>