More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0100 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  72.41 
 
 		 202 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  71.92 
 
 		 202 aa  303  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  72.91 
 
 		 204 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  69.02 
 
 		 202 aa  275  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  57.61 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  57.3 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  55.68 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  56.76 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  55.98 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  50.99 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  48.11 
 
 		 188 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  52.17 
 
 		 194 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  48.91 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  46.49 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  46.49 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 		 188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 		 188 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  45.65 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  47.57 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  46.35 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  44.44 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  45.88 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  41.8 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  38.91 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  41.85 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.21 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  42.19 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  40.1 
 
 		 228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  41.71 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  39.09 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  38.3 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  36.21 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0322  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.332959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  34.31 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2020  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  36.03 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16331  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  28.36 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  28.24 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23621  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.275581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  27.61 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  35.96 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  29.01 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  29.1 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  36.03 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  35.29 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  28.48 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  29.1 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  29.32 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  28.36 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  33.91 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>