More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1574 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
695 aa  1402    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  41.69 
 
 
412 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  35.79 
 
 
404 aa  263  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.8 
 
 
383 aa  126  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  29.86 
 
 
418 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  31.95 
 
 
404 aa  124  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  29.54 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.76 
 
 
390 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  30.26 
 
 
404 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  25.43 
 
 
385 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  27.48 
 
 
440 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  25.97 
 
 
393 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
228 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  25.08 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.23 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  22.38 
 
 
346 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.09 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  32.87 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
162 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
156 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  25.14 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
145 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  21.22 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  35.4 
 
 
165 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  35.22 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  36.7 
 
 
154 aa  71.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  35.22 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  35.22 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  35.22 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  35.22 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.78 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 
159 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
148 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  23.31 
 
 
410 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  28.93 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
165 aa  69.7  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  36.23 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.2 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
148 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
146 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  40.87 
 
 
164 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  36.64 
 
 
148 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  23.55 
 
 
467 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
145 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  30.54 
 
 
174 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
144 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  27.27 
 
 
155 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  30.56 
 
 
149 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
147 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
147 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.65 
 
 
149 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
144 aa  65.1  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
147 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2337  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 
158 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
147 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
147 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 
145 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
147 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  26.75 
 
 
159 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
147 aa  64.3  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.1 
 
 
150 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
148 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
158 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
147 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
144 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2381  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  33.59 
 
 
191 aa  63.9  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
152 aa  63.9  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  30.07 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  34.88 
 
 
144 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
165 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  32.21 
 
 
167 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  32.41 
 
 
173 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.24 
 
 
411 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
145 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 
144 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
144 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 
158 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.27 
 
 
144 aa  60.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
154 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 
150 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  27.88 
 
 
163 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
154 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  36.24 
 
 
166 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.83 
 
 
144 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 
146 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
189 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 
144 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>