140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1130 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 
333 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  35.88 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  35.95 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  35.05 
 
 
323 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  34.1 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  34.23 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  33.66 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.66 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  34.73 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  33.66 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  33.66 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  34.08 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  34.43 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  33.95 
 
 
332 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  34.43 
 
 
323 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
320 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  33.63 
 
 
320 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
320 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
320 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  34.08 
 
 
320 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  34.29 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  33.33 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  33.01 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  32.74 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  32.38 
 
 
349 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  32.74 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  32.06 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  34.27 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  33.03 
 
 
329 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 
365 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32 
 
 
329 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  34.41 
 
 
320 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  31.72 
 
 
364 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  27.9 
 
 
324 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  27.82 
 
 
357 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  27.99 
 
 
364 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  32.01 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.88 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  30.27 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  34.91 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  29.97 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  30.27 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  30.47 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  29.03 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  28.4 
 
 
351 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.64 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.38 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.01 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.85 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.63 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.56 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.71 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  40.97 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.31 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.98 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  26.41 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.8 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2648  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  28.23 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278082  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  24.26 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.74 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.89 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.2 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.38 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2415  chloromuconate cycloisomerase  25.26 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.72 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.85 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.93 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.51 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.85 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.93 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.86 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.05 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.93 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.67 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.93 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.34 
 
 
325 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.32 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.83 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000249838  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 
360 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.75 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.49 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  32.95 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1379  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  23.65 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  23.65 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.19 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  28.47 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.81 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.87 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.48 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.03 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4960  muconate and chloromuconate cycloisomerase  28.57 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.07 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.49 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.04 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  35.29 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3591  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.91 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.33 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>