More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4054 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4054  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1123 aa  2296    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 		 795 aa  239  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 812 aa  178  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.67 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 344 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  27.64 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 351 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.86 
 
 		 351 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 351 aa  77  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 351 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 351 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  19.25 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  19.26 
 
 		 689 aa  74.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.63 
 
 		 351 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  26.07 
 
 		 680 aa  72  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.37 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  28.5 
 
 		 1013 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  25.54 
 
 		 670 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 775 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  25.23 
 
 		 296 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 795 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  21.79 
 
 		 1739 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  34.83 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.41 
 
 		 1048 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  31.91 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.33 
 
 		 797 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  22.52 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 748 aa  65.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  36.67 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  25.36 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 799 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  27.16 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  21.89 
 
 		 403 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 489 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 312 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  35.96 
 
 		 273 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1964  histidine kinase  23.94 
 
 		 475 aa  64.3  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 382 aa  64.3  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 404 aa  63.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 370 aa  63.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  24.06 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  22.47 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  24.06 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  35 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  36.26 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  23.08 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  23.58 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  23.91 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  23.74 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 526 aa  62  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  36.26 
 
 		 670 aa  62  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.96 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  20.68 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  35.58 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  36.67 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 490 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  25.76 
 
 		 462 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  38.71 
 
 		 391 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  24.12 
 
 		 626 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 403 aa  61.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 479 aa  60.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.41 
 
 		 431 aa  60.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 438 aa  60.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  24.48 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  26.87 
 
 		 673 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000510  nitrate/nitrite sensor protein  32.69 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.41 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1560  sensory box sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0374606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  22.48 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>