More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3229 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0231  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.48 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  31.78 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.94 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.18 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.57 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  37.65 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  39.38 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  35.68 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  35.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  32.19 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  35.16 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.09 
 
 		 398 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.74 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  34.66 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.82 
 
 		 410 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.16 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.62 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  35.27 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  31.2 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  34.57 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  34.57 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.62 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.93 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  31.33 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  33.01 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  35.47 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  31.93 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.12 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.23 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.74 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  31.76 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  35.23 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.67 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.87 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  30.17 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  30.71 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.02 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.09 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.24 
 
 		 289 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  32.24 
 
 		 289 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.67 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  30.52 
 
 		 287 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.96 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  34.66 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.04 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  30.57 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.87 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  32.23 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  30.09 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  31.25 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.6 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.25 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  38.26 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  30.57 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  32.63 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.02 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.97 
 
 		 397 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.17 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  30.13 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>