47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0926 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.38 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.88 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30.12 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.07 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 413 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 388 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 387 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.23 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.67 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  26.29 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  24.06 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.12 
 
 		 384 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 366 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 371 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.54 
 
 		 382 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>