More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0885 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  100 
 
 
365 aa  745    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  44.38 
 
 
376 aa  352  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  41.18 
 
 
388 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  38.56 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.29 
 
 
400 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.68 
 
 
385 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  40.64 
 
 
394 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  38.02 
 
 
394 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  40.64 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  38.86 
 
 
383 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  38.83 
 
 
390 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  39.57 
 
 
389 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  37.23 
 
 
387 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  38.83 
 
 
390 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.03 
 
 
395 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  37.93 
 
 
393 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
395 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  38.32 
 
 
383 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 
406 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  38.42 
 
 
383 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 
387 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  38.2 
 
 
396 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  36.97 
 
 
385 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.43 
 
 
381 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  35.26 
 
 
393 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  38.08 
 
 
394 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  36.27 
 
 
394 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  38.07 
 
 
399 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  36.84 
 
 
394 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  37.77 
 
 
391 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  39.04 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  37.56 
 
 
394 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  38.3 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  39.18 
 
 
398 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  35.12 
 
 
381 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  36.05 
 
 
394 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  35.6 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.71 
 
 
388 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  36.63 
 
 
387 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
396 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 
389 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  35.42 
 
 
395 aa  249  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  38.46 
 
 
398 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  38.86 
 
 
397 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  36.05 
 
 
394 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  36.92 
 
 
398 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  34.31 
 
 
400 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  37.04 
 
 
397 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
412 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  36.66 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  36.97 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  38.83 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  38.83 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  35.62 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  35.54 
 
 
390 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  36.04 
 
 
381 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  35.42 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  36.07 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  37.27 
 
 
392 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  38.3 
 
 
390 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  36.77 
 
 
398 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
385 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  35.98 
 
 
387 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  33.87 
 
 
386 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  36.19 
 
 
395 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  36.51 
 
 
398 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  35.2 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  35.81 
 
 
414 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  36.15 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  35.01 
 
 
398 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  35.01 
 
 
398 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 
391 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  35.56 
 
 
393 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  35.71 
 
 
387 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 
389 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  35.28 
 
 
398 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  34.75 
 
 
398 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  34.75 
 
 
398 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  34.75 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  35.9 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  32.7 
 
 
381 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  36.8 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  35.88 
 
 
375 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  34.59 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  34.66 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  33.87 
 
 
379 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  35.82 
 
 
393 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.09 
 
 
383 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  34.38 
 
 
393 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  36 
 
 
395 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  36 
 
 
395 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  36 
 
 
395 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  34.13 
 
 
384 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  35.48 
 
 
388 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  34.13 
 
 
400 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>