More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0182 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  43.22 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  43.56 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  40.89 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.76 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  37.68 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  35.86 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.34 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  34.63 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  38.95 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.06 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.68 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  35.15 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  41.56 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  35.64 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.08 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  41.83 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.75 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  36 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  38.22 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  37.11 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  36.27 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.18 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  35.57 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.31 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.51 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.2 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  34.5 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  35.05 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  34.38 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  36.1 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  36.1 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  36.1 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  34 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  35.89 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.17 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.1 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  32.67 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  34.72 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.52 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  37.72 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  39.58 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  33.16 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  38.02 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  36.22 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  36.36 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  32.84 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  34.18 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.94 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  34.83 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  34.83 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.82 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  35.75 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  36.56 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  34.33 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  33.51 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.77 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  36.81 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  37.63 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  31.1 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  31.1 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>