More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0452 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  100 
 
 		 410 aa  853    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  47.42 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  47.19 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  47.19 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  47.19 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  47.12 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  44.26 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  44.39 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  45.71 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  46.23 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  43.13 
 
 		 420 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  43.35 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  39.81 
 
 		 416 aa  315  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  40.48 
 
 		 1270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  44.38 
 
 		 367 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  41.07 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  42.08 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  36.54 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  39.9 
 
 		 405 aa  288  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  39.81 
 
 		 575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  38.93 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  38.92 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  35.85 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  38.29 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  40.21 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  37.69 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  38 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  37.34 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  35.24 
 
 		 653 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  37.12 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  36.36 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  36.22 
 
 		 453 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  34.09 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  34.34 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  35.18 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  35.15 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  34.04 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  33.83 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.36 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  35.64 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.54 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  34.09 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  35.99 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  35.03 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  34 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.25 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  35.92 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.25 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.59 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  34.96 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  34.29 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  33.59 
 
 		 465 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  32.8 
 
 		 389 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  33.59 
 
 		 465 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  34.47 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.67 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  33.16 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  33.15 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  33.59 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  32.69 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  33.86 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  33.33 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  34.6 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36.1 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  33.68 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.29 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.05 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  33.92 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  32.9 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  31.8 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  32.62 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  34.27 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  30.71 
 
 		 447 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  32.35 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  32.83 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  32.91 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  32.54 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  32.23 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  33.51 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  33.98 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  32.1 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  32.42 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  33.25 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  33.24 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  34.22 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  32.66 
 
 		 465 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  32.66 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  33.17 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  34.52 
 
 		 399 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  33.61 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  34.97 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  33.61 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  34.56 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  33.69 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  33.33 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  32.43 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>