More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3990 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  72.25 
 
 		 178 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  47.65 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  53.16 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  47.06 
 
 		 170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  47.65 
 
 		 170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  47.65 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  47.85 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  49.31 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  49.31 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  40.52 
 
 		 194 aa  87.4  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  43.9 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  39.66 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  40.83 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  41.53 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  38.79 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  40.82 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  37.5 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  38.17 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  46.81 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.13 
 
 		 727 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  37.1 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.13 
 
 		 727 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  37.01 
 
 		 377 aa  74.7  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  34.62 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  36.97 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.49 
 
 		 590 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  39.68 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 		 754 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  39.32 
 
 		 446 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  38.26 
 
 		 751 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  36.97 
 
 		 319 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  41.94 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.29 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  47.13 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  40.22 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.18 
 
 		 824 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.86 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.45 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  36.84 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  37.89 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.94 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  34.38 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  46.59 
 
 		 498 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  33.75 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  37.39 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  38.74 
 
 		 475 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  38.74 
 
 		 475 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.3 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  36.44 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  36.84 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.3 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  42.22 
 
 		 439 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  38.71 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  37.62 
 
 		 294 aa  67.8  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  36.84 
 
 		 328 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  32.17 
 
 		 332 aa  67.4  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  36.84 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36.73 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.33 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  36.96 
 
 		 470 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 433 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  34.41 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  35.34 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6353  hypothetical protein  46.84 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  36.56 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  33.33 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  34.78 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  36.94 
 
 		 491 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  40.23 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  33.9 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  33.05 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  38.33 
 
 		 610 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  41.94 
 
 		 512 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  39.36 
 
 		 669 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  35.77 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  37.7 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  38.71 
 
 		 429 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.94 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.04 
 
 		 353 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  34.92 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  34.71 
 
 		 305 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.82 
 
 		 425 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  37.78 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  37.78 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  38 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  43.33 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  31.93 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  37.78 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.82 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  41.67 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  37.78 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  37.78 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  38.64 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>