More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1786 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 317 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  82.91 
 
 		 372 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  82.97 
 
 		 364 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  78.62 
 
 		 371 aa  534  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  78.3 
 
 		 340 aa  517  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  73.82 
 
 		 372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  76.34 
 
 		 361 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  65.59 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  58.63 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  57.38 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  57 
 
 		 376 aa  362  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  55.7 
 
 		 323 aa  362  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  57.33 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  55.41 
 
 		 329 aa  358  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  54.8 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  53.09 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  54.72 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  57.52 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  55.86 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 375 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  53.44 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  57.52 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  54.75 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  55.74 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  56.15 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 459 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  53.53 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  54.75 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  53.44 
 
 		 365 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  56.35 
 
 		 342 aa  351  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 321 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  54.72 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  55.14 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 375 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  52.7 
 
 		 312 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  56.54 
 
 		 322 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  57.37 
 
 		 372 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  54.37 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  55.08 
 
 		 349 aa  348  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  52.44 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 406 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  55.08 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  52.46 
 
 		 365 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2708  peptide chain release factor 2  58.67 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215879  normal  0.913417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 364 aa  345  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 391 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.79 
 
 		 373 aa  345  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 323 aa  345  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  54.25 
 
 		 321 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.83 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  53.82 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 375 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  54.4 
 
 		 376 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  55.14 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  52.79 
 
 		 377 aa  341  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.43 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  54.4 
 
 		 378 aa  340  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  53.44 
 
 		 365 aa  340  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 		 338 aa  340  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  56.43 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  53.42 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  55.03 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  53.27 
 
 		 322 aa  339  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  53.77 
 
 		 365 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  51.47 
 
 		 380 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>