237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1458 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  78.44 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  75.06 
 
 		 385 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  71.69 
 
 		 385 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  71.17 
 
 		 385 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  69.61 
 
 		 385 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  58.85 
 
 		 386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  56.92 
 
 		 383 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  56.88 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  56.88 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  55.84 
 
 		 384 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  55.58 
 
 		 384 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  55.84 
 
 		 384 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  56.62 
 
 		 384 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  56.36 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  56.88 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  52.21 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  55.06 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  55.84 
 
 		 384 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.37 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  39.62 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.24 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  35.79 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  33.96 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  35.53 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  32.99 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.08 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.5 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.22 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.15 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.15 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.49 
 
 		 1016 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.01 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.15 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.81 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.81 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.81 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.15 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.49 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  26.46 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  20.77 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  23.11 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.83 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.83 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.83 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.34 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.94 
 
 		 876 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 848 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.77 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.57 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  25.67 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.68 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.82 
 
 		 427 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.7 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.99 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.02 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.49 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.49 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.51 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.65 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  19.95 
 
 		 859 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  24.66 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  26.37 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  22.09 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.7 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.46 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 857 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  27.1 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  22.33 
 
 		 662 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.26 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  21.11 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.57 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.46 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.36 
 
 		 850 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.95 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.95 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.69 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  26.03 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  29.3 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  25.08 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>