146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4769 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4769  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6025  hypothetical protein  42.62 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  20.38 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  20.38 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.43 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  38.38 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  21.67 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  41.38 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  42.05 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  20.16 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5115  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  38.82 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25.52 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.57 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  22.75 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  33.82 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.37 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30.63 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  35 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  31.94 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  35 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.9 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  27.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 350 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 323 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 314 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  30.74 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  37.29 
 
 		 288 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 		 301 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  35.64 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  33.68 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.29 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  35.71 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  26.97 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  33.67 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  34.31 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.42 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.51 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  31.91 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  44.05 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  32.58 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  25.71 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  33.82 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.93 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  30.09 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.66 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.41 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>