184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1521 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  100 
 
 		 165 aa  336  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  42.96 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.17 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.52 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40.15 
 
 		 305 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  40.52 
 
 		 211 aa  88.6  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 225 aa  84  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.93 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  39.2 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  34.46 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  35.38 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  41.49 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  35.17 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  30.77 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  42.55 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  39.36 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  41.05 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  33.78 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  34.68 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 300 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  37.38 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  36.17 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  39.36 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  39.36 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  36.17 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  35 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  37.23 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  28.91 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  36.17 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  36.17 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  35.79 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  34.04 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  34.82 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  34.04 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  36.17 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  32.97 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  32.98 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  35.11 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30.6 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  29.32 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.68 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  32.95 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  32.95 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>