245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1325 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  56.98 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  44.91 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  40.4 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  41.03 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  41.7 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  41.33 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  41.33 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  40.96 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  40.96 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  40.59 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  40.59 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  40.59 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  40.59 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  41.82 
 
 		 269 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  44.65 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  38.01 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  38.01 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  38.01 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  38.01 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  37.64 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  37.64 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  38.01 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  37.64 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  37.64 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.13 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  36.71 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 425 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.77 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  35.23 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  36.07 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  36.3 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  35.57 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.19 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  34.36 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  35.38 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  34.93 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  36.73 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  33.1 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  35.9 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  34.22 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  37.59 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  34.27 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  39.13 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  36.18 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  36.8 
 
 		 382 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  37.15 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.62 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  42.54 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  40.44 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  33.57 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  36.73 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35.96 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  32.86 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  37.12 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  38.32 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.58 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  35.25 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  32.31 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  27.91 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  32.97 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  40.15 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  30.71 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  32.68 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  29.03 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  34.25 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  33.69 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  38.94 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  35.1 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  32.09 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  32.57 
 
 		 265 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  35.51 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  35.51 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  35.6 
 
 		 266 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  36.33 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  35.51 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  33.57 
 
 		 483 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  32.85 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  31.83 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  34.69 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  30.85 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  35.32 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  30.85 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  31.91 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  29.03 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>