287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0787 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
279 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  59.68 
 
 
256 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  59.3 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  54.42 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  47.84 
 
 
242 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  48.05 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  57.32 
 
 
166 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  40.16 
 
 
242 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  45.03 
 
 
247 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  46.15 
 
 
243 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  43.86 
 
 
243 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  42.36 
 
 
245 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  42.36 
 
 
245 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  43.35 
 
 
241 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  37.29 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  44.86 
 
 
242 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  46.52 
 
 
240 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  43.59 
 
 
242 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  39.15 
 
 
251 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  34.76 
 
 
242 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  45.08 
 
 
246 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  40.33 
 
 
256 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  43.88 
 
 
249 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  38.84 
 
 
244 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  39.58 
 
 
244 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  44.3 
 
 
249 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  44.3 
 
 
249 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  44.81 
 
 
254 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  37.85 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  40.34 
 
 
243 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  45.9 
 
 
244 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  43.54 
 
 
244 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  45.9 
 
 
246 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  41.63 
 
 
264 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.82 
 
 
240 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  35.59 
 
 
246 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  36.25 
 
 
252 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  40.59 
 
 
254 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  39.26 
 
 
241 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  42.24 
 
 
244 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  42.24 
 
 
244 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  36.52 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  42.24 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  38.63 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  36.05 
 
 
277 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  47.44 
 
 
218 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  38.49 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  37.45 
 
 
282 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  40.24 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  36.91 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  32.19 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  41.03 
 
 
241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  35.69 
 
 
293 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  34.51 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.96 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  32.38 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  34.32 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  37.61 
 
 
321 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  34.76 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.93 
 
 
340 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  33.56 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  32.34 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  36.32 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  41.74 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  37.91 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  34.6 
 
 
308 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  36.57 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  34.63 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  35.85 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  36.79 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  34.32 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  34.56 
 
 
281 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  30.59 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  30.49 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  34.36 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  33.49 
 
 
309 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  33.05 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  34.93 
 
 
267 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  33.05 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  32.05 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  40.11 
 
 
249 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.91 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  33.65 
 
 
267 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  37.38 
 
 
259 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.41 
 
 
296 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  35.56 
 
 
289 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  35.06 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  33.18 
 
 
268 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  32.33 
 
 
316 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  31.8 
 
 
387 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  36.53 
 
 
288 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  32.23 
 
 
282 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  33.49 
 
 
272 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  33.82 
 
 
268 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>