99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0560 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 		 340 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  27.41 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  30.45 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  28.78 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  28.78 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  28.78 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  25.99 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.26 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  27.66 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  50 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  50 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.94 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.93 
 
 		 958 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.64 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.3 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  39.06 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  24.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  24.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  41.27 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.17 
 
 		 421 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1808 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.45 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  27.2 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.82 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.37 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  27.2 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.37 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  39.66 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 1273 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.07 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.66 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.32 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 847 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 		 785 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  42.62 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.86 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 764 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  24.61 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.75 
 
 		 427 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  40.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 		 823 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 851 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.29 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.7 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 1009 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.23 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 1148 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 817 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.09 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.09 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.09 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.94 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.71 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.86 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  43.08 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 		 1589 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.94 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.58 
 
 		 1094 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.82 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.94 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.94 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2453  PAS fold-3 domain protein  27.34 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.68 
 
 		 862 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0933  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.58 
 
 		 456 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  22.32 
 
 		 659 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 682 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.03 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  48.08 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 875 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1552  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.62 
 
 		 947 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.82 
 
 		 433 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  40 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.43 
 
 		 572 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.59 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.38 
 
 		 202 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.38 
 
 		 195 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.67 
 
 		 197 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.29 
 
 		 245 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.82 
 
 		 247 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  32.43 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>