More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2683 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  87.87 
 
 		 313 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  85.86 
 
 		 304 aa  550  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  80.13 
 
 		 305 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  79.14 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  77.23 
 
 		 305 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  76.57 
 
 		 305 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  60.6 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  60.6 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  59.93 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  59.93 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  56.29 
 
 		 303 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  55.63 
 
 		 303 aa  363  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  55.18 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  55.45 
 
 		 303 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  53.64 
 
 		 303 aa  348  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  53.85 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  53.14 
 
 		 303 aa  343  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  54 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  53.16 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  53.16 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  52.15 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  51.3 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  50.83 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  51.16 
 
 		 305 aa  304  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  47.68 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  48.03 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  49.5 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  49.01 
 
 		 306 aa  290  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.7 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.62 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  22.81 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  24.73 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  35.04 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.62 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.76 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.53 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.09 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  24.29 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.48 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.71 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.71 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  24.7 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.9 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  30 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.75 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  30 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.16 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  31.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  30.13 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  40.74 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.33 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  33.33 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  24.8 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  30.97 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.29 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  30.63 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  30.63 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  28.68 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  38.27 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  25.29 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  23.15 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  27.15 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  38.04 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  40.74 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  36.71 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  29.41 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  35.4 
 
 		 403 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.96 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.07 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  26.28 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  26.28 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>