232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1210 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  100 
 
 		 453 aa  943    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  61.52 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  50 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  41.84 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.53 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  40.52 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  35.65 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1028  hypothetical protein  29.53 
 
 		 529 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743991  normal  0.0101542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.81 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.64 
 
 		 353 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  32.87 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.51 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.06 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  30.92 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  30.96 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.61 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  28.09 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  29.14 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  30.61 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  27.94 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  30.35 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  29.66 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  29.52 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.95 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.32 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.32 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.27 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  29.37 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.01 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  29.03 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  29.03 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  28.54 
 
 		 540 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.73 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.48 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  28.31 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  26.73 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.21 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  28.87 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.21 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.21 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.21 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.55 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  28.24 
 
 		 540 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  28.87 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  26.98 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  28.47 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  26.56 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  28.64 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  28.34 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  28.51 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  28.29 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.69 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  26.88 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  28.19 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.29 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  28.28 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.29 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.29 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.29 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  27.48 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  27.97 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  27.48 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  27.48 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  28.44 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  26.79 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.74 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  27.46 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  25.61 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  26.24 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  26.2 
 
 		 336 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 594 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  27.58 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  27.58 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  27.58 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  25.86 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  26.84 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  25.3 
 
 		 616 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  25.69 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  25.5 
 
 		 607 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.68 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  25.65 
 
 		 352 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  24.28 
 
 		 598 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  23.37 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  24 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  24.36 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  23.98 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.33 
 
 		 768 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  24.16 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  25.12 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  26.4 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>