71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0972 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  77.49 
 
 		 191 aa  284  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  62.23 
 
 		 191 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  54.74 
 
 		 193 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  58.5 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  61.85 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  52.91 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  36.02 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  32.77 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  39.38 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  38.36 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  39.62 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.78 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  27.78 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  31.07 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  34.62 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  31.94 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  29.94 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  24.08 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  24.08 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  24.53 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.67 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  28.5 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  23.24 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  25.52 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  25.52 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  25.52 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  24.73 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  25.56 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  28.43 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  25.33 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.07 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  27.59 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  24.71 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  23.96 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  23.08 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  20.41 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  23.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  24.87 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.6 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2407  Fimbrial assembly family protein  25.41 
 
 		 332 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  19.74 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  28 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.76 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  23.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  23.98 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  27.38 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  25.97 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  24.53 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.75 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  26.85 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  27.27 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  26.85 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  26.99 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  21.39 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  27.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  27.85 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  22.28 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  25.45 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  24.1 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  24.04 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  24.86 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  25.48 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  23.2 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  23.61 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  22.28 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1678  Fimbrial assembly family protein  26.9 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  24.2 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0761  hypothetical protein  24.71 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0217944  normal  0.367584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>